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Illumina響應國研院國網中心科技抗疫 免費提供新冠病毒基因定序分析服務
 【記者魏雲日/台北報導】 2021-06-21
        為協助台灣應付新一波疫情對公衛、民生、經濟、教育等面向之衝擊與挑戰,科技部轄下的國家實驗研究院國家高速網路與計算中心(國研院國網中心)於本月初甫啟動科技抗疫2.0專案 ,釋出台灣杉系列超級電腦算力、儲存、大數據資料集及DAS資料分析平台等資源,免費開放各界提案申請運用抗擊疫情。今(6/21)日更進一步宣布,與全球基因定序的領導者Illumina攜手,提供專案申請者新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)病毒基因定序分析服務(COVIDSeqTM),定序樣本數量無限制,且可以無償使用至2021年12月31日,以透過分析病毒的基因定序資料,進行病毒監測、傳播鏈溯源,甚至用於疫苗開發研究。

次世代基因定序是邁向新一代精準醫療或精準健康所需的關鍵核心技術,此技術不僅可用於人體及其他生物,也可用於病毒基因體的解碼。2020年初新冠肺炎(COVID-19)爆發初期,第一個SARS-CoV-2病毒基因體即由 Illumina定序解密,使廠商得以快速開發核酸檢測(PCR)及mRNA疫苗。基因定序也是溯源檢測的一大利器,藉由分析完整的病毒基因圖譜,有助基因序列比對,確認感染者之間的關聯性,並可以觀察是否有新的病毒株產生,找出新的突變位點。

在科技抗疫2.0專案中,國研院國網中心提供的高速基因序列分析設備及平台運算環境,輔以Illumina提供的COVIDSeqTM免費分析流量,可支援國內各大基因定序實驗室、基因體中心、產業界,一天最高處理6,000多個檢體,讓檢體基因定序的研究量能大幅提升,為疫調分析、病毒演化或疫苗開發提供科學上的證據及助益。

科技部吳政忠部長表示,對抗疫情不分國界,Illumina是國際指標性的基因定序技術領導者,科技部引進國際資源,促進公私協力,期以科技共同助力臺灣抗疫工作。國研院國網中心史曉斌主任表示,Illumina的加入為國內研究病毒基因定序分析工作帶來強力奧援,透過超級電腦快速進行病毒分析,將為國內帶來更大抗擊新冠疫情的能量來應對病毒變異之威脅。
科技抗疫2.0專案申請網址:https://reurl.cc/EnRoe0
徵件影片連結:https://youtu.be/Bv2DOXqzvmo
 
 次世代定序( Next Generation Sequencing, NGS):是指傳統定序法的改良版,可進行高速大量且高精度的核酸定序。
 
  llumina, Inc. (ILMN.US)爲全球基因定序的產業龍頭,成立於1998年,總部設在加州的San Diego。該公司提供了一系列的脫氧核糖核酸的陣列和RNA分析應用,包括單核苷酸多態性基因分型、拷貝數目變異分析、基因表現分析,與甲基化分析,以及允許單個陣列上已知的基因標記的檢測。此外,該公司還提供各種文庫製備和測序工具包以簡化工作流程加快分析,還有基因組定序、基因分型和無侵入產前檢測服務。服務對象包含基因組研究中心、學術機構、政府實驗室和醫院,以及醫藥、生物技術、農業基因組合、商業分子診斷實驗室和消費者基因公司。該公司銷售和直接分銷售其產品給在北美、歐洲、拉美和亞太地區的客戶,同時也透過生命科學的分銷商提供服務。